Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
LRRC9Q6ZRR7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LRRC9Q6ZRR7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
LRRC9Q6ZRR7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
LRRC9Q6ZRR7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
LRRC9Q6ZRR7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
LRRC9Q6ZRR7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
LRRC9Q6ZRR7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.5
LRRC9Q6ZRR7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
LRRC9Q6ZRR7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LRRC9Q6ZRR7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms