Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HACD2Q6Y1H2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HACD2Q6Y1H2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms