Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C16orf54Q6UWD8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms