Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUX4L9Q6RFH8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms