Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD54Q6NXT1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms