Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF544Q6NX49 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms