Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUPD1Q68J44 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUPD1Q68J44 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUPD1Q68J44 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUPD1Q68J44 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUPD1Q68J44 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUPD1Q68J44 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUPD1Q68J44 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms