Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TNS3Q68CZ2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNS3Q68CZ2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms