Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GGNBP1Q5YKI7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GGNBP1Q5YKI7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GGNBP1Q5YKI7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GGNBP1Q5YKI7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GGNBP1Q5YKI7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GGNBP1Q5YKI7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GGNBP1Q5YKI7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GGNBP1Q5YKI7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GGNBP1Q5YKI7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GGNBP1Q5YKI7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GGNBP1Q5YKI7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GGNBP1Q5YKI7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GGNBP1Q5YKI7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GGNBP1Q5YKI7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GGNBP1Q5YKI7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GGNBP1Q5YKI7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GGNBP1Q5YKI7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GGNBP1Q5YKI7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GGNBP1Q5YKI7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GGNBP1Q5YKI7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms