Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CARMIL1Q5VZK9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms