Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ECM29Q5VYK3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM29Q5VYK3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms