Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD13Q5VXD3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms