Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF3Q5VWG9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms