Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATRNL1Q5VV63 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRNL1Q5VV63 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms