Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPRD2Q5VT52 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RPRD2Q5VT52 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RPRD2Q5VT52 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms