Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR44Q5JSH3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms