Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM47AQ5JRC9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms