Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms