Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNI3KQ59H18 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3KQ59H18 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms