Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ANKRD39Q53RE8 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms