Protein–RNA interactions for Protein: Q50LG9

LRRC24, Leucine-rich repeat-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC24Q50LG9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC24Q50LG9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC24Q50LG9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms