Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF8Q3BBV2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NBPF8Q3BBV2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms