Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRFIP1Q32MZ4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRFIP1Q32MZ4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRFIP1Q32MZ4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRFIP1Q32MZ4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRFIP1Q32MZ4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRFIP1Q32MZ4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRFIP1Q32MZ4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRFIP1Q32MZ4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRFIP1Q32MZ4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRFIP1Q32MZ4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRFIP1Q32MZ4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRFIP1Q32MZ4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRFIP1Q32MZ4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRFIP1Q32MZ4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRFIP1Q32MZ4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRFIP1Q32MZ4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRFIP1Q32MZ4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRFIP1Q32MZ4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRFIP1Q32MZ4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms