Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTU2Q2VPK5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTU2Q2VPK5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms