Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SPHKAPQ2M3C7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
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