Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GEN1Q17RS7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GEN1Q17RS7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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