Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAPC1Q16533 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAPC1Q16533 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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