Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms