Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDSNQ15517 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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