Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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RYR3Q15413 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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RYR3Q15413 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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RYR3Q15413 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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RYR3Q15413 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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RYR3Q15413 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RYR3Q15413 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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