Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAPTM4AQ15012 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAPTM4AQ15012 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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