Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD1Q15011 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERPUD1Q15011 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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