Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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