Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1CQ13936 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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