Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2H3Q13889 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms