Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNTB1Q13884 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTB1Q13884 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms