Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PKP1Q13835 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKP1Q13835 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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