Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
SHROOM2Q13796 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
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SHROOM2Q13796 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.93■■■□□ 2.7
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SHROOM2Q13796 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
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SHROOM2Q13796 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
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SHROOM2Q13796 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
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SHROOM2Q13796 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
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SHROOM2Q13796 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
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SHROOM2Q13796 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
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SHROOM2Q13796 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
SHROOM2Q13796 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SHROOM2Q13796 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
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