Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P11Q13670 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms