Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FHL3Q13643 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FHL3Q13643 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FHL3Q13643 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FHL3Q13643 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FHL3Q13643 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FHL3Q13643 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FHL3Q13643 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FHL3Q13643 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FHL3Q13643 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FHL3Q13643 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FHL3Q13643 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FHL3Q13643 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FHL3Q13643 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FHL3Q13643 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FHL3Q13643 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FHL3Q13643 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FHL3Q13643 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FHL3Q13643 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FHL3Q13643 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FHL3Q13643 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FHL3Q13643 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FHL3Q13643 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FHL3Q13643 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FHL3Q13643 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FHL3Q13643 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FHL3Q13643 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FHL3Q13643 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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