Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTCH1Q13635 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTCH1Q13635 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms