Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC1Q13547 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC1Q13547 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
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