Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF4BQ13523 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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