Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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MKRN4PQ13434 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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MKRN4PQ13434 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
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MKRN4PQ13434 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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