Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms