Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRSQ13332 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms