Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD2Q13200 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMD2Q13200 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms