Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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RPA4Q13156 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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RPA4Q13156 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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RPA4Q13156 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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RPA4Q13156 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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RPA4Q13156 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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RPA4Q13156 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
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RPA4Q13156 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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RPA4Q13156 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RPA4Q13156 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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