Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALCOCO2Q13137 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCOCO2Q13137 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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