Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLFQ13129 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLFQ13129 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLFQ13129 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLFQ13129 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLFQ13129 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLFQ13129 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLFQ13129 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLFQ13129 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RLFQ13129 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RLFQ13129 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLFQ13129 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLFQ13129 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLFQ13129 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLFQ13129 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLFQ13129 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLFQ13129 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLFQ13129 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLFQ13129 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RLFQ13129 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RLFQ13129 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLFQ13129 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLFQ13129 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLFQ13129 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLFQ13129 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLFQ13129 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLFQ13129 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLFQ13129 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLFQ13129 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLFQ13129 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RLFQ13129 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLFQ13129 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLFQ13129 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RLFQ13129 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLFQ13129 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RLFQ13129 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLFQ13129 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RLFQ13129 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RLFQ13129 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLFQ13129 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLFQ13129 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLFQ13129 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLFQ13129 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLFQ13129 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLFQ13129 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RLFQ13129 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RLFQ13129 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RLFQ13129 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RLFQ13129 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RLFQ13129 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RLFQ13129 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RLFQ13129 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RLFQ13129 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RLFQ13129 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RLFQ13129 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RLFQ13129 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RLFQ13129 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RLFQ13129 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RLFQ13129 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RLFQ13129 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RLFQ13129 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RLFQ13129 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RLFQ13129 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RLFQ13129 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLFQ13129 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLFQ13129 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLFQ13129 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLFQ13129 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLFQ13129 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLFQ13129 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLFQ13129 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLFQ13129 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLFQ13129 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLFQ13129 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLFQ13129 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RLFQ13129 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RLFQ13129 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RLFQ13129 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RLFQ13129 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RLFQ13129 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RLFQ13129 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RLFQ13129 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLFQ13129 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLFQ13129 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RLFQ13129 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLFQ13129 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLFQ13129 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLFQ13129 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLFQ13129 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLFQ13129 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLFQ13129 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLFQ13129 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLFQ13129 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLFQ13129 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLFQ13129 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLFQ13129 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLFQ13129 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLFQ13129 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLFQ13129 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RLFQ13129 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms